Одна из основных целей Приокско-Террасного заповедника — сохранение и восстановление, редких и исчезающих видов растений и животных.
Редкие и исчезающие виды растений и животных занесены в Красные книги России, а также её регионов. Эти виды подлежат особой охране, а за их уничтожение взимаются штрафы и возмещение ущерба. В России Красные Книги — это юридический документ, на основании которых предпринимаются меры по защите и сохранению редких видов растений и животных вплоть до уголовного преследования лиц, причастных к их уничтожению.
Растения и животные заповедника из Красной Книги
В заповеднике произрастает 8 видов растений, занесенных в Красную Книгу России:
- рябчик русский (Fritillaria ruthenica Wikstr., 1827)
- рябчик шахматный (Fritillaria meleagris L., 1753)
- ковыль перистый (Stipa pennata L. 1753)
- венерин башмачок желтый (Cypripedium calceolus)
- неоттианта клобучковая (Neottianthe cucullata () Schltr., 1919)
- пальчатокоренник Траутенштейнера (Dactylorhiza traunsteineri (ex Rchb.) Soó,1962)
- ятрышник обожженый (Orchis ustulata L.)
- ятрышник шлемоносный (Orchis militaris , 1753)
В заповеднике произрастает 88 видов сосудистых растений включенных в Красную книгу Московской области. Из представителей степной «окской флоры» в неё включены 30 видов, в том числе:
- тюльпан Биберштейна (Tulipa biebersteiniana et Schult.)
- чемерица черная (Veratrum nigrum)
- вероника седая (Veronica incana)
- ломонос прямой Clematis recta)
- змееголовник Руйша (Dracocephalum ruyschiana) и др.
Из 620 зарегистрированных на территории заповедника видов бабочек 71 являются редкими, занесёнными в Красную книгу Московской области.
В границах Приокско-Террасного биосферного резервата встречается 50 видов птиц, занесённых в Красную книгу Московской области. Эти виды составляют 74% списка Красной книги МО, что подтверждает роль Приокско-Террасного биосферного резервата, как территории, важной для сохранения фауны птиц в регионе.
При этом, на территории заповедника зарегистрирован 32 вид птиц с особым охранным статусом. Из них:
7 видов птиц занесены в Красную книгу России и в Красную книгу Московской области:
- чёрный аист (Ciconia nigra)
- скопа (Pandion haliaetus)
- орлан-белохвост (Haliaeetus albicilla)
- филин (Bubo bubo)
- средний пёстрый дятел (Dendrocopos medius)
- серый сорокопут (Lanius excubitor)
- белая лазоревка (Parus cyanus)
Остальные 25 видов птиц с особым охранным статусом внесены в Красную книгу Московской области и/или Международную Красную книгу (Красный список Международного союза охраны природы (МСОП)):
- белый аист (Ciconia ciconia)
- лебедь-кликун (Cygnus Cygnus)
- шилохвость (Anas acuta)
- обыкновенный осоед (Pernis apivorus)
- чёрный коршун (Milvus migrans)
- полевой лунь (Circus cyaneus)
- луговой лунь (Circus pygargus)
- кобчик (Falco subbuteo)
- серый журавль (Grus grus)
- фифи (Tringa glareola)
- голубь клинтух (Columba oenas)
- обыкновенная горлица (Streptopelia turtur)
- сплюшка (Otus scops)
- домовый сыч (Athene noctua)
- длиннохвостая неясыть (Strix uralensis)
- обыкновенный зимородок (Alcedo atthis)
- удод (Upupa epops)
- зеленый дятел (Picus viridis)
- седой дятел (Picus canus)
- белоспинный дятел (Dendrocopos leucotos)
- трехпалый дятел (Picoides tridactylus)
- лесной жаворонок (Lullula arborea)
- кедровка (Nucifraga caryocatactes)
- ястребиная славка (Sylvia nisoria)
- красноголовый нырок (Aythya ferina)
Достопримечательностью заповедника является организованный в 1948 году «Центральный зубровый питомник», сыгравший ключевую роль в восстановлении и разведении зубра в России.
Зубр (Bison bonasus L.), для сохранения которого Приокско-Террасный заповедник сыграл огромную роль благодаря созданному здесь Центральному зубровому питомнику и его длительной работе по разведению зубров, начиная с 1948 г. внесен в Красную книгу Российской Федерации (2001) и Международную Красную книгу (Красный список Международного союза охраны природы (МСОП). Благодаря совместным усилиям по сохранению этого вида, в 2001 году зубр был переведен в Красном списке МСОП из категории исчезающих видов (EN) в категорию уязвимых видов (VU).
В настоящее время вольный выпас зубров за пределами питомника не практикуется и зверь не включен в список обитающих в заповеднике «краснокнижных» видов.
В последнее (3 издание от 24 декабря 2018 г.) Красной книги Московской области внесены 6 видов млекопитающих заповедника:
- крошечная бурозубка (Sorex minutissimus)
- ночница Наттерера (Myotis nattereri)
- прудовая ночница (Myotis dasycnemeBoie)
- орешниковая соня (Muscardinus avellanarius)
- речная выдра (Lutra lutra)
- обыкновенная рысь (Lynx lynx)